RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD50	Q92878	1312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNA1G	O43497	2377 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CASK	O14936	926 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC01565	O15544	149 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE5A	O76074	875 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GAT3	O94766	335 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHG1	P01857	330 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SP1	P08047	785 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IL9	P15248	144 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NBL1	P41271	181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SULT1E1	P49888	294 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PPT1	P50897	306 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CALCOCO2	Q13137	446 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF146	Q15072	292 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CHI3L2	Q15782	390 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TATDN3	Q17R31	274 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PMF1	Q6P1K2	205 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52J3	Q8NH60	311 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NDE1	Q9NXR1	346 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TET1	Q8NFU7	2136 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TECTA	O75443	2155 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR23A	A6NEV1	266 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF212B	A8MTL3	300 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	AP3B1	O00203	1094 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TM9SF1	O15321	606 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GJB5	O95377	273 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ADCY5	O95622	1261 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ANP32D	O95626	131 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IL1B	P01584	269 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV1-44	P01699	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OPN1LW	P04000	364 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IGF1	P05019	195 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TPM2	P07951	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA3	P12429	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEA5	P43359	124 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	HILS1	P60008	231 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TIMM10	P62072	90 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFRSF17	Q02223	184 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BNIP1	Q12981	228 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2V2	Q15819	145 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK6	Q16659	721 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF3	Q5VWG9	929 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXL22	Q6P050	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CYS1	Q717R9	158 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC43	Q8N309	656 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	METTL4	Q8N3J2	472 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKFN1	Q8N957	763 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS33	Q8NF86	280 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF139	Q8WU17	664 aa		3.34	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms