RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MORN4Q8NDC4 146 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF145Q96MT1 663 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR51I1Q9H343 314 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR54Q9H977 334 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NECTIN3Q9NQS3 549 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AASSQ9UDR5 926 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C3orf18Q9UK00 162 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FRYLO94915 3013 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A087X0M5 115 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GX30 115 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A6NLC8 198 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR6C76A6NM76 312 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MUI8 341 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IDSB3KWA1 339 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F5H0A9 414 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UPK1AO00322 258 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ASNA1O43681 348 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALOX12BO75342 701 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFSF15O95150 251 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNK5O95279 499 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSMG1O95456 288 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF682O95780 498 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AK1P00568 194 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMGN1P05114 100 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPIP06744 558 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 QDPRP09417 244 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCK1P16333 377 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GGT1P19440 569 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCN2P20062 427 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP6V1C1P21283 382 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCGF2P35227 344 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASP9P55211 416 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSPAN5P62079 268 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MS4A2Q01362 244 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHAGQ02094 409 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAB1Q13480 694 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIPK1Q13546 671 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTB4RQ15722 352 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2L13Q8N349 312 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COX18Q8N8Q8 333 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR7G2Q8NG99 324 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BBS10Q8TAM1 723 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX47Q8TBZ9 253 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR151Q8TDV0 419 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF31Q96EP0 1072 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR7D2Q96RA2 312 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STACQ99469 402 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LPAR4Q99677 370 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM2Q9C040 744 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR10A5Q9H207 317 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHST8Q9H2A9 424 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LANCL2Q9NS86 450 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NTMQ9P121 344 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AURKCQ9UQB9 309 aa5.2□□□□□ -1.58
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms