RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PIGU	Q9H490	435 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	POT1	Q9NUX5	634 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF11	Q9UIL8	331 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	FRYL	O94915	3013 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A087WV62	115 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM247	A6NEH6	219 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SOCS6	O14544	535 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CTDSP2	O14595	271 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	DVL2	O14641	736 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM1A	O60341	852 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MPZL2	O60487	215 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PLOD3	O60568	738 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NKX2-2	O95096	273 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OR5F1	O95221	314 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CH25H	O95992	272 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP1B1	P05026	303 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PROS1	P07225	676 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NGFR	P08138	427 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ADRB1	P08588	477 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	LIMS3	P0CW19	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	LIMS4	P0CW20	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	HSMCR30	P0CW71	290 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NT5E	P21589	574 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TBXA2R	P21731	343 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SSTR4	P31391	388 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	GABRA3	P34903	492 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	STAT5A	P42229	794 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINB10	P48595	397 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	GFER	P55789	205 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R41	P59536	307 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RHAG	Q02094	409 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	COX10	Q12887	443 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SQSTM1	Q13501	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM53B	Q14153	422 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OXA1L	Q15070	435 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1Q1	Q15612	314 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ISX	Q2M1V0	245 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	DCST2	Q5T1A1	773 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RNLS	Q5VYX0	342 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ADCK1	Q86TW2	530 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC34A3	Q8N130	599 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MCFD2	Q8NI22	146 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM163	Q8TC26	289 aa		5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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