RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492440.1

TTLL3-229, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,549 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-229ENST00000492440 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 MGLLQ99685 303 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 A0A087WUJ7 227 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 A0A1W2PQD3 144 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TMEM221A6NGB7 291 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 M0R296 226 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 M0R3G1 203 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 PTP4A3O75365 173 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SCRG1O75711 98 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 UBL4AP11441 157 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 HPGDP15428 266 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 DAB2P98082 770 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SLC34A3Q8N130 599 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 RNF217Q8TC41 542 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 LGALS12Q96DT0 336 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 LMF1Q96S06 567 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SPTBP11277 2137 aa14.68□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TECTAO75443 2155 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 AIREO43918 545 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TSPAN2O60636 221 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 PPM1BO75688 479 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SCG5P05408 212 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 FGF5P12034 268 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 NR4A1P22736 598 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 HTR1FP30939 366 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 MTNR1AP48039 350 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SLC9A3P48764 834 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 LIMK1P53667 647 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 CDH11P55287 796 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TUBA1BP68363 451 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SKP2Q13309 424 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TMED1Q13445 227 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 MED22Q15528 200 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 MOGQ16653 247 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TUBA1AQ71U36 451 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 GID4Q8IVV7 300 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 CADM2Q8N3J6 435 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 RNFT2Q96EX2 444 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 OR5M11Q96RB7 305 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 JAM3Q9BX67 310 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 C12orf10Q9HB07 376 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TMEM129A0AVI4 362 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 PATE3B3GLJ2 98 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 CCRL2O00421 344 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 MYL12BO14950 172 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF264O43296 627 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 CSO75390 466 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 RFPL3O75679 317 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 TIAF1O95411 115 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 INHBBP09529 407 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF883P0CG24 379 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 PNMTP11086 282 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 MYL12AP19105 171 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 GADD45AP24522 165 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SLC6A8P48029 635 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-229ENST00000492440 SERPINB10P48595 397 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms