RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488452.5

NELFA-215, Transcript of negative elongation factor complex member A, human

TSL 4

Gene NELFA, Length 560 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NELFA-215	ENST00000488452	ALG2	Q9H553	416 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	TMEM114	B3SHH9	223 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	COPE	O14579	308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ADAM11	O75078	769 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	NDUFS7	O75251	213 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	FGF4	P08620	206 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	KRT16	P08779	473 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SLC7A1	P30825	629 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PPA1	Q15181	289 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	STK11	Q15831	433 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452		A0A1W2PNR3	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	RNF212B	A8MTL3	300 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452		C9JVG2	144 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ZNF264	O43296	627 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	TRIM13	O60858	407 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	RAMP1	O60894	148 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	LYZL6	O75951	148 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	LAMP1	P11279	417 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	MAPK1	P28482	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	C21orf58	P58505	322 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ZNF524	Q96C55	264 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	MID2	Q9UJV3	735 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ATR	Q13535	2644 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	CYTIP	O60759	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PGM3	O95394	542 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SHBG	P04278	402 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	KRT4	P19013	534 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	CBFB	Q13951	182 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	QPRT	Q15274	297 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	NRF1	Q16656	503 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	CR1	P17927	2039 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ESPN	B1AK53	854 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	ABCD4	O14678	606 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	SSX4	O60224	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	PEX11A	O75192	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NELFA-215	ENST00000488452	UBL4A	P11441	157 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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