RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 POGLUT1Q8NBL1 392 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 BBS10Q8TAM1 723 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 KAT2AQ92830 837 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 WDR34Q96EX3 536 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 SLC38A3Q99624 504 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 UBL3O95164 117 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 NHLRC1Q6VVB1 395 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 SIRT6Q8N6T7 355 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 MED20Q9H944 212 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 PLSCR5A0PG75 271 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 HACD4Q5VWC8 232 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 AMER3Q8N944 861 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 OR5W2Q8NH69 310 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 SPPL3Q8TCT6 385 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 GINS4Q9BRT9 223 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 D6RAR5 112 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 LATO43561 262 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 B3GALNT1O75752 331 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 TBC1D19Q8N5T2 526 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 KLK6Q92876 244 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 NEURL3Q96EH8 262 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 GIMAP5Q96F15 307 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 OR52A5Q9H2C5 316 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-212ENST00000488380 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa12.53□□□□□ -0.4
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NISCH-212ENST00000488380 J3QLW9 94 aa12.52□□□□□ -0.41
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NISCH-212ENST00000488380 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
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NISCH-212ENST00000488380 ELP2Q6IA86 826 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 PLBD1Q6P4A8 553 aa12.52□□□□□ -0.41
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NISCH-212ENST00000488380 MORN4Q8NDC4 146 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR11G2Q8NGC1 345 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 FGF11Q92914 225 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 MED11Q9P086 117 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa12.52□□□□□ -0.41
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