RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PVRIGQ6DKI7 326 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF491Q8N8L2 437 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SUMF1Q8NBK3 374 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP37Q8NFH4 326 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2T33Q8NG76 320 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7G2Q8NG99 324 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM110BQ8TC76 370 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SCARB1Q8WTV0 552 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2E3Q969T4 207 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 NUS1Q96E22 293 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SERAC1Q96JX3 654 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCC1Q96S66 551 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SIKE1Q9BRV8 207 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR13Q9H1Z4 485 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 BFARQ9NZS9 450 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 RARRES3Q9UL19 164 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPV9 198 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EQG2 157 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 FCN1O00602 326 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ACOT8O14734 319 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 BMP15O95972 392 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHG1P01857 330 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 CD80P33681 288 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 THBS3P49746 956 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA2P54652 639 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 RND3P61587 244 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ST3GAL3Q11203 375 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 CUL1Q13616 776 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO48Q5FWF7 155 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 REP15Q6BDI9 236 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SSX9Q7RTT3 188 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS33Q8NF86 280 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 LYZL4Q96KX0 146 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PRRC1Q96M27 445 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB34Q9BZG1 259 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2F2O95006 317 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM50AO95807 157 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPIND1P05546 499 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 GNB3P16520 340 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKACAP17612 351 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMP3P35625 211 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGA2P52926 109 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVFC1-1P60608 527 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SRPXP78539 464 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 VGLL4Q14135 290 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 NECTIN1Q15223 517 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A18Q3C1V0 323 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM120AOSQ5T036 256 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 LGSNQ5TDP6 509 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SCD5Q86SK9 330 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 HPS6Q86YV9 775 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2L13Q8N349 312 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8K3Q8NH51 312 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 GPX8Q8TED1 209 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 NRGNQ92686 78 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SGK3Q96BR1 496 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R16AQ96I34 528 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 PANX2Q96RD6 677 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-209ENST00000473406 MLXQ9UH92 298 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms