RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 DUSP19Q8WTR2 217 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CNIH4Q9P003 139 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 E9PQ18 207 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CHP2O43745 196 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 OR6B1O95007 311 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 OMPP47874 163 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 TMED10P49755 219 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 COPZ1P61923 177 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 TTC9Q92623 222 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 FAM117AQ9C073 453 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GALNT9Q9HCQ5 603 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 WDR70Q9NW82 654 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 NTRK2Q16620 822 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF691Q5VV52 312 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ULK3Q6PHR2 472 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM239Q8WW34 195 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ICAM5Q9UMF0 924 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GMPPBQ9Y5P6 360 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 SOX14O95416 240 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GSSP48637 474 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 OR5M10Q6IEU7 315 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 RAB43Q86YS6 212 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 PFN4Q8NHR9 129 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 PIGXQ8TBF5 258 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GNB5O14775 395 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CHMP24386 653 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 IFNGR2P38484 337 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 MLF1P58340 268 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 IGF2-ASQ6U949 168 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 IL20RBQ6UXL0 311 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 PNPLA3Q9NST1 481 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 MAGEA13PA6NCF6 341 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 TP53P04637 393 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 OSMP13725 252 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 MST1P26927 711 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ITPKBP27987 946 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 POU1F1P28069 291 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CAMK2BQ13554 666 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 KEAP1Q14145 624 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CD300LDQ6UXZ3 194 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 THAP5Q7Z6K1 395 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 P3H2Q8IVL5 708 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 RNF138Q8WVD3 245 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 C3orf49Q96BT1 292 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 HRASLS5Q96KN8 279 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 C20orf141Q9NUB4 165 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 SERPINA7P05543 415 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GPR4P46093 362 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CRISP1P54107 249 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 GAS1P54826 345 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ISL1P61371 349 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM236Q5W0B7 351 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 WBP2NLQ6ICG8 309 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 LINC00114Q6XXX2 140 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 SIRT6Q8N6T7 355 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 UBE2FQ969M7 185 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 COX10Q12887 443 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ARMC10Q8N2F6 343 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ASB15Q8WXK1 588 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 PITX2Q99697 317 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF426Q9BUY5 554 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 AASSQ9UDR5 926 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 B4DXG7 233 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 LIFP15018 202 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 PTGDSP41222 190 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 SSR4P51571 173 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ESRRGP62508 458 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 CHAF1BQ13112 559 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 IL18R1Q13478 541 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 OPN5Q6U736 354 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 OR5W2Q8NH69 310 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF563Q8TA94 476 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms