RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470115.1

GTF3C2-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-209ENST00000470115 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 NINJ1Q92982 152 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ARSGQ96EG1 525 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 NEURL3Q96EH8 262 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 CCDC115Q96NT0 180 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 UGT2B17O75795 530 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 GOSR1O95249 250 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 AGR2O95994 175 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 PRKCAP17252 672 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ELK4P28324 431 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 UGT2B10P36537 528 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 CTBP2P56545 445 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 SKP2Q13309 424 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 MAPK14Q16539 360 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 INPP5KQ9BT40 448 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 LAT2Q9GZY6 243 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 EDARQ9UNE0 448 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 A0A1W2PPR1 153 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 CCDC154A6NI56 674 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 C16orf97H3BN30 126 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 NTN1O95631 604 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 CSTAP01040 98 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 CCKARP32238 428 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 KHKP50053 298 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 FUT5Q11128 374 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 CBFBQ13951 182 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 QPRTQ15274 297 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ROPN1LQ96C74 230 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 ZG16BQ96DA0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 MARK4Q96L34 752 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 OR52E6Q96RD3 313 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 FOXC2Q99958 501 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 MED18Q9BUE0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 TIGARQ9NQ88 270 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 WDR45Q9Y484 360 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-209ENST00000470115 MED13LQ71F56 2210 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 HMGN4O00479 90 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 KIAA0513O60268 411 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 GSNP06396 782 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 PGRP06401 933 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 CDKN2CP42773 168 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 ZNF550Q7Z398 422 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 RNF130Q86XS8 419 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 PANX1Q96RD7 426 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 ZBTB18Q99592 522 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 POLE3Q9NRF9 147 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 GLRX2Q9NS18 164 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 GJE1A6NN92 205 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 SIAH2O43255 324 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 DNAJA2O60884 412 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 RAF1P04049 648 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-209ENST00000470115 GUSBP08236 651 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms