RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TM2D1Q9BX74 207 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RAB33BQ9H082 229 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CUTCQ9NTM9 273 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CRLS1Q9UJA2 301 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 KDRP35968 1356 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PALLDQ8WX93 1383 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 EFCAB7A8K855 629 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RHBDL1O75783 438 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 B3GAT3O94766 335 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 UFL1O94874 794 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLC2A10O95528 541 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NT5EP21589 574 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ACVR1BP36896 505 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NTHL1P78549 312 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 BDH1Q02338 343 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PAX2Q02962 417 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RUNX3Q13761 415 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLC10A1Q14973 349 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC57Q2TAC2 916 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RABGAP1LQ5R372 815 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF774Q6NX45 483 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SCYL2Q6P3W7 929 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CES3Q6UWW8 571 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CYS1Q717R9 158 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM17Q86X19 198 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CDC20BQ86Y33 519 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RAET1EQ8TD07 263 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 MYLPFQ96A32 169 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R16AQ96I34 528 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RANBP9Q96S59 729 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 L3MBTL1Q9Y468 752 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 FMN2Q9NZ56 1722 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GLI3P10071 1580 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NALCNQ8IZF0 1738 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 FAM74A7A6NL05 159 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 A8MUI8 341 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ERVV-1B6SEH8 477 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 IGF1P05019 195 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 HBQ1P09105 142 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TPSB2P20231 275 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TBXA2RP21731 343 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PSMA5P28066 241 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 FNTAP49354 379 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 IST1P53990 364 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 DPYSL3Q14195 570 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TPSAB1Q15661 275 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 FAM74A3Q4VXF1 159 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TEX44Q53QW1 395 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PVRIGQ6DKI7 326 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SERPINA9Q86WD7 417 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLC39A11Q8N1S5 342 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 DENND6BQ8NEG7 585 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF606Q8WXB4 792 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 OSTF1Q92882 214 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SDSLQ96GA7 329 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 RHOJQ9H4E5 214 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PALMDQ9NP74 551 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLC7A10Q9NS82 523 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 DPM3Q9P2X0 92 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CHRNA9Q9UGM1 479 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NFAT5O94916 1531 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 NWD2Q9ULI1 1742 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PNV4 684 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CCT8L1PA6NM43 557 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 A8MX80 341 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 STX7O15400 261 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 ZSCAN12O43309 604 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 EFNA2O43921 213 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CLUP10909 449 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 PGAM2P15259 253 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 IDSP22304 550 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC82-202ENST00000423339 CA8P35219 290 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms