RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 FOXK2Q01167 660 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 POU4F2Q12837 409 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 OTULINQ96BN8 352 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ST6GAL2Q96JF0 529 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TIMP4Q99727 224 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 GSDMCQ9BYG8 508 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 RNF121Q9H920 327 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SCN3AQ9NY46 2000 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SGK494L7N484 410 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TPRA1Q86W33 373 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 FRMD6Q96NE9 622 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TRIM2Q9C040 744 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 A0A0B4J2E0 115 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GX12 115 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 DAPL1A0PJW8 107 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 BLACEA4D250 179 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 FAM172BPA6NC97 362 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PEX12O00623 359 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PLPP2O43688 288 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 LDB3O75112 727 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MT-ND5P03915 603 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 GABRA3P34903 492 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TPMTP51580 245 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TAB1Q15750 504 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TMEM53Q6P2H8 277 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 LSMEM1Q8N8F7 131 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 C19orf18Q8NEA5 215 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PFN4Q8NHR9 129 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TEAD3Q99594 435 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 RNF32Q9H0A6 362 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CHRDQ9H2X0 955 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.98■■□□□ 1.11
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PMS1-205ENST00000409985 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 RIIAD1A6NNX1 92 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 LRRTM2O43300 516 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 GKN3PP0CG01 181 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 GSTT2P0CG29 244 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 GSTT2BP0CG30 244 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 LSSP48449 732 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ACTC1P68032 377 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ACTA1P68133 377 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TRIQKQ629K1 86 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 Q8N402 240 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TMEM52Q8NDY8 209 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PTP4A1Q93096 173 aa21.97■■□□□ 1.11
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PMS1-205ENST00000409985 KCNJ15Q99712 375 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CD93Q9NPY3 652 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 IL20RAQ9UHF4 553 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 FAM183AA6NL82 134 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 HPGDSO60760 199 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SLC2A5P22732 501 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MYL9P24844 172 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MAP2K3P46734 347 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ID2Q02363 134 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 QPRTQ15274 297 aa21.96■■□□□ 1.11
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PMS1-205ENST00000409985 RTL4Q6ZR62 310 aa21.96■■□□□ 1.11
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF860A6NHJ4 632 aa21.96■■□□□ 1.11
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PMS1-205ENST00000409985 HK1P19367 917 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 IFITM2Q01629 132 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A6Q92536 515 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 IFT27Q9BW83 186 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SHISA3A0PJX4 238 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 CENPXA8MT69 81 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-205ENST00000409985 IDH3BO43837 385 aa21.95■■□□□ 1.1
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