RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MSX1P28360 303 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OPRD1P41143 372 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GPR85P60893 370 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LSM3P62310 102 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TSPAN31Q12999 210 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC17A1Q14916 467 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NPNTQ6UXI9 565 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF620Q6ZNG0 422 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF627Q7L945 461 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF101Q8IZC7 436 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR51A4Q8NGJ6 313 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 APH1BQ8WW43 257 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NTNG2Q96CW9 530 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF878C9JN71 531 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 K7EQM0 130 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ALDOBP05062 364 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CTSAP10619 480 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CPN1P15169 458 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 AMZ1Q400G9 498 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 CARFQ8N187 725 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 STACQ99469 402 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MFFQ9GZY8 342 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LHPPQ9H008 270 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BCO1Q9HAY6 547 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 IL26Q9NPH9 171 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PPL8 197 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 A8MUI8 341 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ABCD4O14678 606 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ST8SIA5O15466 376 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GALTP07902 379 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CCKARP32238 428 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 IL10RAQ13651 578 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TATDN3Q17R31 274 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SYS1Q8N2H4 156 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf35Q96D05 121 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC30A3Q99726 388 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR51I1Q9H343 314 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 V9GY05 133 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LY75O60449 1722 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01387J3KSC0 135 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SELEP16581 610 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC1A3P43003 542 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MTCP1P56278 107 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NFATC2Q13469 925 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SBSNQ6UWP8 590 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CAMKMTQ7Z624 323 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC5A8Q8N695 610 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 PIF1Q9H611 641 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 F2RL1P55085 397 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PMS2P3Q13401 168 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RAB33AQ14088 237 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 IQCJQ1A5X6 159 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TEX19Q8NA77 164 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR4E2Q8NGC2 313 aa4.62□□□□□ -1.67
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