RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 LRFN1Q9P244 771 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HMX3A6NHT5 357 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 IL2RAP01589 272 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS56P0CW18 603 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 UGT2B7P16662 529 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 KITLGP21583 273 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HTR2AP28223 471 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CSNK1DP48730 415 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HES5Q5TA89 166 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RTL6Q6ICC9 239 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MGLLQ99685 303 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 EDEM2Q9BV94 578 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ABHD16AO95870 558 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CTSCP53634 463 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 EPHA5P54756 1037 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RGNQ15493 299 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM135Q86UB9 458 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 Q8N402 240 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 NPWQ8N729 165 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SUN5Q8TC36 379 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF566Q969W8 418 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TLCD2A6NGC4 264 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 EDN3P14138 238 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 AHRP35869 848 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SGSHP51688 502 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 TP53I3Q53FA7 332 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MAL2Q969L2 176 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SNX18Q96RF0 628 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PPV4 95 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 H0YAE9 185 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 EGFP01133 1207 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HBMQ6B0K9 141 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CPOQ8IVL8 374 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MFRPQ9BY79 579 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CNIH4Q9P003 139 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HHLA2Q9UM44 414 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 STUB1Q9UNE7 303 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HSPB11Q9Y547 144 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SERPINA7P05543 415 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PHC1P78364 1004 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 OR52W1Q6IF63 320 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC32Q9BV29 185 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MMP27Q9H306 513 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 OSMP13725 252 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SERPINA2P20848 420 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PKLRP30613 574 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GJA5P36382 358 aa9.88□□□□□ -0.83
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TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R31P59538 309 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FAM57BQ71RH2 274 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 IFI44Q8TCB0 444 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ST7LQ8TDW4 575 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FEVQ99581 238 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.88□□□□□ -0.83
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