RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB40BQ12829 278 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 RNLSQ5VYX0 342 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 SLCO6A1Q86UG4 719 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 SCRG1O75711 98 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 MYL12AP19105 171 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINB10P48595 397 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH11P55287 796 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 DGUOKQ16854 277 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC29A4Q7RTT9 530 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 GATSQ8NAP1 163 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 IFI44Q8TCB0 444 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 HCN1O60741 890 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 UTS2O95399 124 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 ENTPD1P49961 510 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR143P51810 404 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 EBPQ15125 230 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 SPHARQ15513 63 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TSTQ16762 297 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 FAAH2Q6GMR7 532 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 COX15Q7KZN9 410 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 PLPP5Q8NEB5 264 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 PROKR2Q8NFJ6 384 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF426Q9BUY5 554 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TGIF2Q9GZN2 237 aa22.02■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 CCRL2O00421 344 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 REM1O75628 298 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 UBL4AP11441 157 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 IL12BP29460 328 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 NANOGP1Q8N7R0 232 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1N1Q8NGS0 311 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 ADOQ96SZ5 270 aa22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TECTAO75443 2155 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 CSO75390 466 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 RFPL3O75679 317 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 MOGQ16653 247 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 PHF19Q5T6S3 580 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 LANCL3Q6ZV70 420 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 ADCK1Q86TW2 530 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 OAFQ86UD1 273 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 PRR22Q8IZ63 422 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 OTULINQ96BN8 352 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 IFT27Q9BW83 186 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 PLGRKTQ9HBL7 147 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 GNB5O14775 395 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TBXA2RP21731 343 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 GRK5P34947 590 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 ADH7P40394 386 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 CCR4P51679 360 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 FXYD6P3P58550 94 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 C3orf38Q5JPI3 329 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 OR51A7Q8NH64 312 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 NRSN2Q9GZP1 204 aa22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAV27A0A087WT01 109 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC14CA4D256 554 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGAP33O14559 1287 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 TIAF1O95411 115 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A10O95528 541 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 NADKO95544 446 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 NXNL2Q5VZ03 156 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 WWTR1Q9GZV5 400 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 DCSTAMPQ9H295 470 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1-201ENST00000007264 OR6C76A6NM76 312 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms