RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 TMEM237Q96Q45 408 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 BBS4Q96RK4 519 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 MED11Q9P086 117 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 H3BQF6 201 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 CD5LO43866 347 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SUPT7LO94864 414 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 NKX2-2O95096 273 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SYNGR4O95473 234 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ANGPTL1O95841 491 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 PLAUP00749 431 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 IFNA2P01563 188 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 JUNP05412 331 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 CHN1P15882 459 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 TAC1P20366 129 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ME2P23368 584 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 LCN1P31025 176 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 LSP1P33241 339 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 IDUAP35475 653 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SLC29A2Q14542 456 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GRAMD1BQ3KR37 738 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 LGSNQ5TDP6 509 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 APOOLQ6UXV4 268 aa4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 Q6ZS46 218 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SSX8Q7RTT4 187 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GALNT10Q86SR1 603 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 MARCH3Q86UD3 253 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 DTX2Q86UW9 622 aa4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 CNPY4Q8N129 248 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GABRG1Q8N1C3 465 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 METTL6Q8TCB7 284 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 S100PBPQ96BU1 408 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ELP4Q96EB1 424 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 APIPQ96GX9 242 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 KLHL15Q96M94 604 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 RNF145Q96MT1 663 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 AMDHD1Q96NU7 426 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 MS4A4EQ96PG1 132 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 FMO2Q99518 471 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 EBPLQ9BY08 206 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 REG4Q9BYZ8 158 aa4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 MKS1Q9NXB0 559 aa4.89□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 VDAC3Q9Y277 283 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 A0A096LNT2 108 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 A0A1W2PP18 115 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 A0A1W2PQD3 144 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 A0A1W2PRB8 838 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GOLGA8OA6NCC3 632 aa4.88□□□□□ -1.63
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