RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 GGNQ86UU5 652 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 MCEMP1Q8IX19 187 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ZNF619Q8N2I2 560 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 GPR119Q8TDV5 335 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ARSGQ96EG1 525 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 RNF145Q96MT1 663 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.42■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SEC14L5O43304 696 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 DNAJA2O60884 412 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 PRF1P14222 555 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ADH6P28332 368 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 RAC1P63000 192 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 HPCAP84074 193 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SKP2Q13309 424 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 MAPK14Q16539 360 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 COX20Q5RI15 118 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SFXN3Q9BWM7 321 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 LAT2Q9GZY6 243 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ZNF175Q9Y473 711 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A20A6NK97 555 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 H6PDO95479 791 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 NUDT14O95848 222 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 TGM6O95932 706 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ELK4P28324 431 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ASCL1P50553 236 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 FGFBP1Q14512 234 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SYPL1Q16563 259 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 GPAT3Q53EU6 434 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 PLXDC2Q6UX71 529 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 OR5W2Q8NH69 310 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SMPDL3BQ92485 455 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 PMM1Q92871 262 aa22.41■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 CSTAP01040 98 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 CHRNEQ04844 493 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 FOXF2Q12947 444 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SQLEQ14534 574 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 ANKFN1Q8N957 763 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 FAM71CQ8NEG0 241 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SPDL1Q96EA4 605 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 PINK1Q9BXM7 581 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SLC38A1Q9H2H9 487 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 NPHS2Q9NP85 383 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 JKAMPQ9P055 326 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.4■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 CREBBPQ92793 2442 aa22.39■■□□□ 1.18
PMS1-220ENST00000618056 SYT5O00445 386 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 ADAMDEC1O15204 470 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 CRHP06850 196 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 PRKCAP17252 672 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 ME2P23368 584 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 FOXF1Q12946 379 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 CBFBQ13951 182 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 GTDC1Q4AE62 458 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 SLC25A53Q5H9E4 307 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 OR2A2Q6IF42 318 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 P4HA3Q7Z4N8 544 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 ZG16BQ96DA0 208 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 LRRC46Q96FV0 321 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 ADGRG7Q96K78 797 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 MRGPRX4Q96LA9 322 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 DCTN4Q9UJW0 460 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa22.39■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 A0A096LPI6 279 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 NTN1O95631 604 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 CHRM4P08173 479 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 PGM1P36871 562 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 DLX5P56178 289 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa22.38■■□□□ 1.17
PMS1-220ENST00000618056 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.38■■□□□ 1.17
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