RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	SPCS2	Q15005	226 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TMED2	Q15363	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ABHD13	Q7L211	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM156	Q8N614	296 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PIGU	Q9H490	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	RNF121	Q9H920	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PTPRC	P08575	1304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	GOSR2	O14653	212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	CHST1	O43916	411 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MFAP3L	O75121	409 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	DIRAS1	O95057	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	LRAT	O95237	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PSMG1	O95456	288 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TNNC2	P02585	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ANXA3	P12429	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF43	P17038	809 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PSMC3	P17980	439 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	NPR2	P20594	1047 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	DTYMK	P23919	212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	OR1E1	P30953	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	CALCR	P30988	508 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	CD79B	P40259	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MNDA	P41218	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	GNPDA1	P46926	289 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	VAMP7	P51809	220 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	XK	P51811	444 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	CTSC	P53634	463 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	HLA-B	Q31612	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1-208	ENST00000598594	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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