RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587662.1

PTPRH-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, human

TSL 4

Gene PTPRH, Length 571 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRH-205	ENST00000587662	NDUFS7	O75251	213 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	PRKCA	P17252	672 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	ME2	P23368	584 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	SERPINB4	P48594	390 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	PPP2R2B	Q00005	443 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	STK32C	Q86UX6	486 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	TDRP	Q86YL5	185 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	GPR119	Q8TDV5	335 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	MTERF3	Q96E29	417 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	STAC	Q99469	402 aa		20.71	■□□□□ 0.91
PTPRH-205	ENST00000587662	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CD8A	P01732	235 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	NEFH	P12036	1026 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ADH6	P28332	368 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CDKN1A	P38936	164 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	GALNTL6	Q49A17	601 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	FCRLA	Q7L513	359 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	JADE3	Q92613	823 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	C3orf30	Q96M34	536 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	HHATL	Q9HCP6	504 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		20.7	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PIP5K1B	O14986	540 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CLOCK	O15516	846 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ADA	P00813	363 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	IGHV4-39	P01824	125 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	FGF4	P08620	206 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	KRT4	P19013	534 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CCT5	P48643	541 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	P2RX1	P51575	399 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	XKR7	Q5GH72	579 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CDC73	Q6P1J9	531 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PSD2	Q9BQI7	771 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	TRIM2	Q9C040	744 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	H6PD	O95479	791 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	YES1	P07947	543 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	HPGD	P15428	266 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ACVR1B	P36896	505 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	BSPH1	Q075Z2	132 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PTGR1	Q14914	329 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	DCST2	Q5T1A1	773 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ZFP90	Q8TF47	636 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	REG4	Q9BYZ8	158 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	BCO1	Q9HAY6	547 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	GP6	Q9HCN6	339 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PRSS50	Q9UI38	385 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	LIPT1	Q9Y234	373 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662		A0A1W2PNR3	127 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SMIM23	A6NLE4	172 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	COPE	O14579	308 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	RAMP1	O60894	148 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	PRKD3	O94806	890 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ASMT	P46597	345 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	VEZF1	Q14119	521 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	BANP	Q8N9N5	519 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	CCDC63	Q8NA47	563 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	HSD17B8	Q92506	261 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	FBXW5	Q969U6	566 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	TRMO	Q9BU70	441 aa		20.67	■□□□□ 0.9
PTPRH-205	ENST00000587662	MECR	Q9BV79	373 aa		20.67	■□□□□ 0.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms