RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553287.5

ATXN3-217, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-217ENST00000553287 ADCK1Q86TW2 530 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 VPS36Q86VN1 386 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 HORMAD1Q86X24 394 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TEX26Q8N6G2 289 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RNF139Q8WU17 664 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C11orf52Q96A22 123 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C19orf60Q96EN9 201 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TAAR6Q96RI8 345 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 DUSP16Q9BY84 665 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CLIC5Q9NZA1 410 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 COX16Q9P0S2 106 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 NSG2Q9Y328 171 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.59□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ANKRD36A6QL64 1941 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 LRP4O75096 1905 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 TRIM49BA6NDI0 452 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 EFCAB7A8K855 629 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 A8MU76 341 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF749O43361 778 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 RAD1O60671 282 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 SH3BGRLO75368 114 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 HLA-DRAP01903 254 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 GAP43P17677 238 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 KRT20P35900 424 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ACY1Q03154 408 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CDC20Q12834 499 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 OVGP1Q12889 678 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 KLRB1Q12918 225 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 BTNL8Q6UX41 500 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 Q6ZVQ6 151 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 GPR141Q7Z602 305 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 PARGQ86W56 976 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 IQUBQ8NA54 791 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CCL4L1Q8NHW4 92 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ART4Q93070 314 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 AK8Q96MA6 479 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 STRADBQ9C0K7 418 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 BLZF1Q9H2G9 400 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 APMAPQ9HDC9 416 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ANXA2P2A6NMY6 339 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 LMO7DNF2Z398 122 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 K7EQG2 157 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 MCF2LO15068 1137 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 TXNL1O43396 289 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 B4GAT1O43505 415 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 STX6O43752 255 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 IGLV3-27P01718 113 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CTNNA2P26232 953 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CHRNA3P32297 505 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 LONP1P36776 959 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 RABIFP47224 123 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 GCLMP48507 274 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 DAOAP59103 153 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 INCA1Q0VD86 236 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 Q71RC1 249 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 UNC93AQ86WB7 457 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 CARM1Q86X55 608 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 ARL10Q8N8L6 244 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 PATE1Q8WXA2 126 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-217ENST00000553287 STARD8Q92502 1023 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms