RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 PTNP21246 168 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 SMSP52788 366 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 RNF4P78317 190 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 CD226Q15762 336 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 KIF26BQ2KJY2 2108 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 ALG10BQ5I7T1 473 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 PRSS48Q7RTY5 328 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 OR8J1Q8NGP2 316 aa21.35■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 CLCA1A8K7I4 914 aa21.34■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 NUBP1P53384 320 aa21.34■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 LPAR4Q99677 370 aa21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 ZNF426Q9BUY5 554 aa21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 CXorf56Q9H5V9 222 aa21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 AMBNQ9NP70 447 aa21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 FKBP14Q9NWM8 211 aa21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 IL20Q9NYY1 176 aa21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 MED31Q9Y3C7 131 aa21.34■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.34■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 NUDT6P53370 316 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 SLC27A4Q6P1M0 643 aa21.33■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 APOOLQ6UXV4 268 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 HSDL2Q6YN16 418 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 GATSQ8NAP1 163 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 TP53INP1Q96A56 240 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 COPS4Q9BT78 406 aa21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACER3-204ENST00000525861 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa21.33■■□□□ 1.01
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ACER3-204ENST00000525861 MT-ND2P03891 347 aa21.33■■□□□ 1
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ACER3-204ENST00000525861 TMEM201Q5SNT2 666 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 KIRREL2Q6UWL6 708 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 CADM2Q8N3J6 435 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 CLDN22Q8N7P3 220 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 OR13F1Q8NGS4 319 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 OSTF1Q92882 214 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 VMP1Q96GC9 406 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 EDEM2Q9BV94 578 aa21.33■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.33■■□□□ 1
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ACER3-204ENST00000525861 IFI30P13284 250 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 PCYT1AP49585 367 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 COPZ1P61923 177 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 SKP2Q13309 424 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 DESI1Q6ICB0 168 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 MRGPREQ86SM8 312 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 SVOPQ8N4V2 548 aa21.32■■□□□ 1
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ACER3-204ENST00000525861 GGHQ92820 318 aa21.32■■□□□ 1
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ACER3-204ENST00000525861 MUL1Q969V5 352 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 Q96MT0 163 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 SEC14L2O76054 403 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 NGFRP08138 427 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 CTBP2P56545 445 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 TUBA3CQ13748 450 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 FAM198BQ6UWH4 519 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 CDK20Q8IZL9 346 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 TCEANCQ8N8B7 351 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 NUBPLQ8TB37 319 aa21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACER3-204ENST00000525861 MYDGFQ969H8 173 aa21.32■■□□□ 1
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