RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C19orf35Q6ZS72 473 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC186Q7Z3E2 898 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM126BQ8IUX1 230 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF664Q8N3J9 261 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC58Q96CX6 371 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB118Q96PH6 123 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STACQ99469 402 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSG101Q99816 390 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHDC3Q9BQ90 382 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPOQ9BU64 300 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A22Q9H936 323 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC40A1Q9NP59 571 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL28Q9NRJ3 127 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTNL2Q9UIR0 455 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIGLEC9Q9Y336 463 aa-0.04□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KAT6BQ8WYB5 2073 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GVX0 72 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IDSB3KWA1 339 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 E9PBE3 544 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LGALS9O00182 355 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPIHO43447 177 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HCRTR1O43613 425 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPST2O60704 377 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STK17BO94768 372 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LALBAP00709 142 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GH1P01241 217 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REG3AQ06141 175 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFRSF9Q07011 255 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYCNQ0VAF6 134 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDC20Q12834 499 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KARSQ15046 597 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IRF4Q15306 451 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBE2V2Q15819 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBE2SQ16763 222 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM183BQ1AE95 376 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf146Q5VVC0 180 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLX4IPQ5VYV7 408 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXW9Q5XUX1 488 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LEG1Q6P5S2 330 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC39A4Q6P5W5 647 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMZ2Q86W34 360 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF573Q86YE8 665 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIAH3Q8IW03 269 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF679Q8IYX0 411 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NHLRC2Q8NBF2 726 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10G9Q8NGN4 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5W2Q8NH69 310 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARPC1AQ92747 370 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADIPOR1Q96A54 375 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AP2M1Q96CW1 435 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASB9Q96DX5 294 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FERMT1Q9BQL6 677 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM121Q9BTD3 319 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANGPTL4Q9BY76 406 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACOXLQ9NUZ1 547 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS54Q9P1Q0 977 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SWAP70Q9UH65 585 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRBP1Q9UHY1 535 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF25Q9UIL4 384 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB23Q9ULC3 237 aa-0.05□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0G2JN53 185 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GWB2 263 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLAC8L1A1L4L8 177 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OVOL1O14753 267 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFLARO15519 480 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTI1O43156 1089 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GMNNO75496 209 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAD51DO75771 328 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C8orf89P0DMQ9 161 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDGF1P13385 188 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ICAM2P13598 275 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STIP1P31948 543 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERPINB6P35237 376 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDGF1P3P51864 188 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STARD6P59095 220 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TGFBR3Q03167 851 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF616Q08AN1 781 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZP4Q12836 540 aa-0.06□□□□□ -2.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP2R5CQ13362 524 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms