RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 STK38Q15208 465 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 Q3ZCU0 254 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC153Q494R4 210 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 AARDQ4LEZ3 155 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 MUC21Q5SSG8 566 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CD302Q8IX05 232 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 SLC43A2Q8N370 569 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 BANPQ8N9N5 519 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 OR8K3Q8NH51 312 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 SAP25Q8TEE9 199 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 FAM162AQ96A26 154 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 RUNDC3BQ96NL0 473 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM237Q96Q45 408 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 FANCEQ9HB96 536 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 BATF3Q9NR55 127 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 ANO10Q9NW15 660 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 MBD2Q9UBB5 411 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CFL2Q9Y281 166 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 GMEB1Q9Y692 573 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 HCFC1P51610 2035 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 MGAQ8IWI9 3026 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 MAGEB16A2A368 324 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 LRRD1A4D1F6 860 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 KRT87PA6NCN2 255 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 IGLON5A6NGN9 336 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 NIPSNAP2O75323 286 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CLN5O75503 358 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 ERLIN2O94905 339 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 RLN1P04808 185 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 IVLP07476 585 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 HEXBP07686 556 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 GOLGA8HP0CJ92 632 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-220ENST00000512069 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-220ENST00000512069 IER3P46695 156 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 HNMTP50135 292 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-220ENST00000512069 CBX3Q13185 183 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-220ENST00000512069 CUL1Q13616 776 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CEACAM7Q14002 265 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 PON2Q15165 354 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 CFAP157Q5JU67 520 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC31Q6UY01 552 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-220ENST00000512069 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-220ENST00000512069 LIPHQ8WWY8 451 aa3.45□□□□□ -1.86
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PDE4D-220ENST00000512069 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 COQ7Q99807 217 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 C17orf62Q9BQA9 187 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-220ENST00000512069 FAM107BQ9H098 131 aa3.45□□□□□ -1.86
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