RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRDMT1-211ENST00000495022 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.09■□□□□ 0.81
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM233B4DJY2 109 aa20.08■□□□□ 0.81
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TRDMT1-211ENST00000495022 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 SFRP5Q5T4F7 317 aa20.07■□□□□ 0.8
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TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.06■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
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TRDMT1-211ENST00000495022 HSD17B8Q92506 261 aa20.06■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 MOAP1Q96BY2 351 aa20.06■□□□□ 0.8
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TRDMT1-211ENST00000495022 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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TRDMT1-211ENST00000495022 P2RY6Q15077 328 aa20.05■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 ETFDHQ16134 617 aa20.05■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.05■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.05■□□□□ 0.8
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TRDMT1-211ENST00000495022 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
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TRDMT1-211ENST00000495022 COQ8BQ96D53 544 aa20.05■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.05■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 OVOL3O00110 214 aa20.04■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 PEX11AO75192 247 aa20.04■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 C6orf47O95873 294 aa20.04■□□□□ 0.8
TRDMT1-211ENST00000495022 CD3EP07766 207 aa20.04■□□□□ 0.8
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