RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489772.5

GGA1-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 2

Gene GGA1, Length 1,384 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-222	ENST00000489772	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	OR5W2	Q8NH69	310 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	GPR119	Q8TDV5	335 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ZFP90	Q8TF47	636 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	STON2	Q8WXE9	905 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PINK1	Q9BXM7	581 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	LAT2	Q9GZY6	243 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF175	Q9Y473	711 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	NCKAP5	O14513	1909 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	GJE1	A6NN92	205 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	OIP5	O43482	229 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	C1QC	P02747	245 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	CRH	P06850	196 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	NR2F1	P10589	423 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FCGR2A	P12318	317 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ELK4	P28324	431 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SSTR2	P30874	369 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	UQCRC1	P31930	480 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	CRAT	P43155	626 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ATP4B	P51164	291 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	CHRNE	Q04844	493 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FUT5	Q11128	374 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FOXF1	Q12946	379 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FOXF2	Q12947	444 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SKP2	Q13309	424 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	GNA13	Q14344	377 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SQLE	Q14534	574 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	MAPK14	Q16539	360 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	COX20	Q5RI15	118 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	GGN	Q86UU5	652 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	LILRA2	Q8N149	483 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ANKFN1	Q8N957	763 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	POC1B	Q8TC44	478 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	GTF2H4	Q92759	462 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ARSG	Q96EG1	525 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	NPAS1	Q99742	590 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	NPHS2	Q9NP85	383 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772		A0A0G2JND7	137 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	TMEM247	A6NEH6	219 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	NR5A2	O00482	541 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ADAMDEC1	O15204	470 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	OPN1LW	P04000	364 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	CHRM4	P08173	479 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PRKCA	P17252	672 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PGM1	P36871	562 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FGFBP1	Q14512	234 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PON3	Q15166	354 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	QPRT	Q15274	297 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	SYPL1	Q16563	259 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	AGK	Q53H12	422 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA1-222	ENST00000489772	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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