RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 NADKO95544 446 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 TMED10P49755 219 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 COPZ1P61923 177 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 RPP38P78345 283 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 SKP2Q13309 424 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF691Q5VV52 312 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 C1orf94Q6P1W5 598 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 MARCH9Q86YJ5 346 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 SETD9Q8NE22 299 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 GRHL3Q8TE85 626 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 CARD8Q9Y2G2 431 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0B4J2E0 115 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1B0GWA3 101 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1B0GX12 115 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 NDUFB5O43674 189 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 OR2J2O76002 312 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 LINGO3P0C6S8 592 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 EVI2BP34910 448 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 ESRRGP62508 458 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 COX10Q12887 443 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 MARCH3Q86UD3 253 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 CADM2Q8N3J6 435 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 OR5M3Q8NGP4 307 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 APOL4Q9BPW4 351 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 PRSS27Q9BQR3 290 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-210ENST00000489475 FADS1O60427 444 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 LYPD3O95274 346 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 FBXW4P57775 412 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 RAPSNQ13702 412 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CD300LDQ6UXZ3 194 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF786Q8N393 782 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 TMCO6Q96DC7 493 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 HRASLS5Q96KN8 279 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 SELENONQ9NZV5 590 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 SCOCQ9UIL1 159 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CHP2O43745 196 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 NTN1O95631 604 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CELA2AP08217 269 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 OSMP13725 252 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CCR4P51679 360 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 ULK3Q6PHR2 472 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 SLC15A4Q8N697 577 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 PITX2Q99697 317 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 LAT2Q9GZY6 243 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 MYRFQ9Y2G1 1151 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 OIP5O43482 229 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 ICAM2P13598 275 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 GSTM3P21266 225 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 ALG10BQ5I7T1 473 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 NUP54Q7Z3B4 507 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 NRMQ8IXM6 262 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM239Q8WW34 195 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 REV1Q9UBZ9 1251 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 TERTO14746 1132 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 HCRTR2O43614 444 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 F8A1P23610 371 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CD82P27701 267 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CBLN3Q6UW01 205 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 WDR88Q6ZMY6 472 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 MPP4Q96JB8 637 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 HS6ST2Q96MM7 605 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 RTN4RQ9BZR6 473 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF696Q9H7X3 374 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 FBXL4Q9UKA2 621 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 E9PQ18 207 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 SCO2O43819 266 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 ANGPTL1O95841 491 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 HPP00738 406 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 SLC6A8P48029 635 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CRISP1P54107 249 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 IL5RAQ01344 420 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM154Q6P9G4 183 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 TTC9Q92623 222 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 RASL10BQ96S79 203 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 FAM186AA6NE01 2351 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 CHMP24386 653 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 POU1F1P28069 291 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-210ENST00000489475 OMPP47874 163 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms