RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FAR1	Q8WVX9	515 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KAT2A	Q92830	837 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ISOC1	Q96CN7	298 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	VSTM2L	Q96N03	204 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1F2P	Q96R84	312 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NODAL	Q96S42	347 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SCN3B	Q9NY72	215 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR45	Q9Y484	360 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087WUU8	490 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GTQ1	180 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ENO4	A6NNW6	628 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CLCA1	A8K7I4	914 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM227A	F5H4B4	570 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R3H8	397 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN4	O14493	209 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS10	O43665	173 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DUX1	O43812	170 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FCMR	O60667	390 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LDB3	O75112	727 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP7B1	O75881	506 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GABARAP	O95166	117 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LYPD3	O95274	346 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CDK1	P06493	297 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CT62	P0C5K7	136 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ALPPL2	P10696	532 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4B1	P13584	511 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NT5E	P21589	574 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FPR3	P25089	353 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CD1C	P29017	333 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PTGER1	P34995	402 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RORA	P35398	523 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNGR2	P38484	337 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OMP	P47874	163 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	AVPR1B	P47901	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EMD	P50402	254 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GFER	P55789	205 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC42	P60953	191 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OLR1	P78380	273 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	HSD11B2	P80365	405 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	HPCA	P84074	193 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZXDA	P98168	799 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CFHR1	Q03591	330 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DMWD	Q09019	674 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ST3GAL3	Q11203	375 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPAN31	Q12999	210 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAM2	Q15035	370 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF141	Q15928	474 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GPAT3	Q53EU6	434 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DEF8	Q6ZN54	512 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		Q7L0L9	218 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	VRK2	Q86Y07	508 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59

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