RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485067.1

USP16-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 16, humanhuman

TSL 2

Gene USP16, Length 2,259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16-206ENST00000485067 C6orf47O95873 294 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TGFB1P01137 390 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 IGHEP01854 428 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 FMO3P31513 532 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TAS2R50P59544 299 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 PMP22Q01453 160 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 PIGFQ07326 219 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 GPM6BQ13491 265 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 LAPTM4AQ15012 233 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 CTF1Q16619 201 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 Q5PR19 223 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 REC114Q7Z4M0 266 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 LUZP2Q86TE4 346 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 S100ZQ8WXG8 99 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 FCGR1BQ92637 280 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 RIT1Q92963 219 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 MAL2Q969L2 176 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 S100PBPQ96BU1 408 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 MFFQ9GZY8 342 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 OPA3Q9H6K4 179 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 PELI2Q9HAT8 420 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SCML1Q9UN30 329 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 COL4A3Q01955 1670 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 A0A1W2PRB8 838 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 BTBD17A6NE02 478 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 EPOPA6NHQ4 379 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TSPAN2O60636 221 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TBX19O60806 448 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 MMP20O60882 483 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ONECUT2O95948 504 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ERGP11308 486 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ACADMP11310 421 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ETFAP13804 333 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ZP3P21754 424 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 UQCRC2P22695 453 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TGFBR2P37173 567 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 CDK6Q00534 326 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ACTBL2Q562R1 376 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 Q5BKY6 102 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 AGAP6Q5VW22 663 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 IQCHQ86VS3 1027 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 AMZ2Q86W34 360 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 PARP8Q8N3A8 854 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 HTRA1Q92743 480 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 YIPF6Q96EC8 236 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 COX14Q96I36 57 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 AGAP4Q96P64 663 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ZNF559Q9BR84 538 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 GAREM1Q9H706 876 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 COPZ2Q9P299 210 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 ASF1AQ9Y294 204 aa8.63□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.62□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.62□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 H7C2Y5 167 aa8.62□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 IFNA6P05013 189 aa8.62□□□□□ -1.03
USP16-206ENST00000485067 KLK1P06870 262 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms