RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 PSMA8Q8TAA3 256 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 OR7D2Q96RA2 312 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ACTR6Q9GZN1 396 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 OR10A4Q9H209 315 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 DSCAMO60469 2012 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ZNF264O43296 627 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SLC7A1P30825 629 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 CCR4P51679 360 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 VSNL1P62760 191 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 CBFBQ13951 182 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 PRSS57Q6UWY2 283 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 Q71RC1 249 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 Q96MF0 132 aa18■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 HDHD5Q9BXW7 423 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 GPATCH2Q9NW75 528 aa18■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 EMBQ6PCB8 327 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa17.99■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 PLPPR2Q96GM1 343 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 MARK4Q96L34 752 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 MRGPRX4Q96LA9 322 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 CXorf56Q9H5V9 222 aa17.99■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 ICAM5Q9UMF0 924 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 WDR91A4D1P6 747 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 THBDP07204 575 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 IL32P24001 234 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 HBA1P69905 142 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 EMX2Q04743 252 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 GPR68Q15743 365 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 C22orf34Q6ZV56 151 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 FCRLAQ7L513 359 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 C16orf62Q7Z3J2 963 aa17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 OR5W2Q8NH69 310 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 GPR119Q8TDV5 335 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SLC35G5Q96KT7 338 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 GP6Q9HCN6 339 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SERINC1Q9NRX5 453 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 EXD2Q9NVH0 621 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 KLHL13Q9P2N7 655 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 KCNE3Q9Y6H6 103 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
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ACTB-212ENST00000484841 STX11O75558 287 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 PRKCAP17252 672 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SHC1P29353 583 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 QPRTQ15274 297 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SMU1Q2TAY7 513 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 NDUFAF6Q330K2 333 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ATAD3BQ5T9A4 648 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 C6orf120Q7Z4R8 191 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 TUSC5Q8IXB3 177 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 RIMKLAQ8IXN7 391 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 VPS37AQ8NEZ2 397 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 OR4A15Q8NGL6 344 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R36Q96LQ0 422 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ZIM3Q96PE6 472 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SDF2Q99470 211 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 KLHDC3Q9BQ90 382 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SRXN1Q9BYN0 137 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 DPY30Q9C005 99 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 KLHL9Q9P2J3 617 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SERINC4A6NH21 518 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 H7C1Q1 480 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 OIP5O43482 229 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 AGR2O95994 175 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 HEXAP06865 529 aa17.96■□□□□ 0.47
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