RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 BMP7P18075 431 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 CHMP24386 653 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 GFRA1P56159 465 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 VMACQ2NL98 169 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF311Q5JNZ3 666 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 RNF220Q5VTB9 566 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 VASNQ6EMK4 673 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 ERICH5Q6P6B1 374 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 ENPP6Q6UWR7 440 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 CALHM3Q86XJ0 350 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 ARSGQ96EG1 525 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 LINC01387J3KSC0 135 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 SERPINB7O75635 380 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 PCGF2P35227 344 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 MNAT1P51948 309 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 PLPPR5Q32ZL2 321 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF836Q6ZNA1 936 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 GPR119Q8TDV5 335 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 UGT2B28Q9BY64 529 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 CDHR4A6H8M9 788 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF17P17021 662 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 PGCP20142 388 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 AQP1P29972 269 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 CA7P43166 264 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 SLC6A8P48029 635 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 C3AR1Q16581 482 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 SLC15A3Q8IY34 581 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 EID3Q8N140 333 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF583Q96ND8 569 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 TIMP4Q99727 224 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 CMTM6Q9NX76 183 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 TINAGQ9UJW2 476 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-208ENST00000476342 A0A1B0GUH1 482 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 OR2M5A3KFT3 312 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 C7orf72A4D263 438 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PRORSD1PA6NEY8 169 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 FIGNL2A6NMB9 653 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 FAM220BPB1ANY3 271 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 EIF1P41567 113 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 SLC7A2P52569 658 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 B3GALT5-AS1P59052 145 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 KCNC4Q03721 635 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 GXYLT1Q4G148 440 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 C1QL3Q5VWW1 255 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF440Q8IYI8 595 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PM20D2Q8IYS1 436 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 OR2T12Q8NG77 320 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 MED12Q93074 2177 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 DNAJA2O60884 412 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 LINGO3P0C6S8 592 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PRKAR1BP31321 381 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PSME3P61289 254 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 DOLPP1Q86YN1 238 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 OR5M9Q8NGP3 310 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 KLHDC3Q9BQ90 382 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 SPAG4Q9NPE6 437 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PNPLA3Q9NST1 481 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 NDE1Q9NXR1 346 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 STOML1Q9UBI4 398 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 FASNP49327 2511 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 CCT8L1PA6NM43 557 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 UQCRBP14927 111 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 MXRA7P84157 204 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PLAURQ03405 335 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 VEZF1Q14119 521 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 QPRTQ15274 297 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 TMEM44Q2T9K0 475 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 C4orf17Q53FE4 359 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 OR5M1Q8NGP8 315 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 TMEM234Q8WY98 164 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 PRDM14Q9GZV8 571 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 RLIMQ9NVW2 624 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 WDR1O75083 606 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 ADH6P28332 368 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 RYKP34925 604 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 EMC4Q5J8M3 183 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-208ENST00000476342 DCST1Q5T197 706 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms