RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-211ENST00000429899 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-211ENST00000429899 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-211ENST00000429899 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-211ENST00000429899 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-211ENST00000429899 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-211ENST00000429899 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 SH3D21A4FU49 640 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ACOT7O00154 380 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 CASKO14936 926 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 SUSD5O60279 629 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 OR10H2O60403 315 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ENTPD5O75356 428 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ARAFP10398 606 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 GABRA1P14867 456 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 S1PR1P21453 382 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 CFPP27918 469 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 MAP3K8P41279 467 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 KHKP50053 298 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 DSTNP60981 165 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 FUT5Q11128 374 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 STX4Q12846 297 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 MAP4K2Q12851 820 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 VEZF1Q14119 521 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 MAPK11Q15759 364 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 CYP51A1Q16850 503 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 VMACQ2NL98 169 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 IFNEQ86WN2 208 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM156Q8N614 296 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 NUP43Q8NFH3 380 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 DGAT2Q96PD7 388 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 PIF1Q9H611 641 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 AQP12BA6NM10 295 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 H0YHG0 523 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 HRKO00198 91 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 HMGN4O00479 90 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 MGRN1O60291 552 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 COQ9O75208 318 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ACP2P11117 423 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 NCK1P16333 377 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 CRATP43155 626 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 CRYBA2P53672 197 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 CASP9P55211 416 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 RBBP4Q09028 425 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 FUT7Q11130 342 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 BIKQ13323 160 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 RIPK1Q13546 671 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 CDC73Q6P1J9 531 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 SZRD1Q7Z422 152 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 MEIOBQ8N635 442 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 DOK4Q8TEW6 326 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 IGFBPL1Q8WX77 278 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 MAL2Q969L2 176 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 SARAFQ96BY9 339 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 PIGQQ9BRB3 760 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 BEX2Q9BXY8 128 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 ADAM19Q9H013 955 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 OR51I1Q9H343 314 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 LDAHQ9H6V9 325 aa9.13□□□□□ -0.95
ATG4B-211ENST00000429899 EXO5Q9H790 373 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms