RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 KCNK1O00180 336 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6AP2O75787 350 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 NPPAP01160 153 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 FGF2P09038 288 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 LINGO3P0C6S8 592 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 KITP10721 976 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRK-211ENST00000429595 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 Q9H521 79 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 CHODLQ9H9P2 273 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRK-211ENST00000429595 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRK-211ENST00000429595 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 LYNP07948 512 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 EPHA3P29320 983 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 TIMP3P35625 211 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ACVR1BP36896 505 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 NAGLUP54802 743 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 MLF1P58340 268 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LUZP2Q86TE4 346 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 DDHD1Q8NEL9 900 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 OR56A3Q8NH54 315 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ART5Q96L15 291 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MED18Q9BUE0 208 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.58□□□□□ -1.52
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