RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 GRB7Q14451 532 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ITIH4Q14624 930 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 POU6F1Q14863 301 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MORF4L2Q15014 288 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ACKR1Q16570 336 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FAM57BQ71RH2 274 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC91Q7Z6B0 441 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TDRPQ86YL5 185 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KRT222Q8N1A0 295 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TC2NQ8N9U0 490 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SMPDL3BQ92485 455 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 P3H4Q92791 437 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RITA1Q96K30 269 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PAFAH2Q99487 392 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 VAT1Q99536 393 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 BEX2Q9BXY8 128 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RTN4RQ9BZR6 473 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 GBA3Q9H227 469 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RHBGQ9H310 441 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TAC3Q9UHF0 121 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MYO6Q9UM54 1294 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KLK4Q9Y5K2 254 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0A0MQY5 61 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PPV9 198 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRK-210ENST00000415055 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 RHODO00212 210 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRK-210ENST00000415055 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CD5LO43866 347 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CST8O60676 142 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 HCN1O60741 890 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PROP1O75360 226 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OR2J2O76002 312 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MYO1DO94832 1006 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OR6B1O95007 311 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 IGHG3P01860 377 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 P04436 131 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FHP07954 510 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MAOAP21397 527 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CNR1P21554 472 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 JAK1P23458 1154 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OPRM1P35372 400 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SOX3P41225 446 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NR2C2P49116 596 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 GPR143P51810 404 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF136P52737 540 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 BTG2P78543 158 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FAM27E3Q08E93 113 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NAE1Q13564 534 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TFDP2Q14188 446 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CDONQ4KMG0 1287 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SGO1Q5FBB7 561 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KCTD11Q693B1 232 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.09□□□□□ -1.75
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