RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 PP2D1A8MPX8 630 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 A8MXK9 166 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 H0YIV9 168 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 H3BMQ9 156 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 EDIL3O43854 480 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRYGBP07316 175 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALOX5P09917 674 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM49P0CI25 452 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM49CP0CI26 452 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC130P13994 396 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 HILS1P60008 231 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 OGDHQ02218 1023 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLRB1Q12918 225 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 C1orf220Q5T0J3 134 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMUB2Q71RG4 321 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TPRA1Q86W33 373 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM69Q86WT6 500 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALLCQ8N6M5 410 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAIP1Q8WWC4 291 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 RHBGQ9H310 441 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 EXO5Q9H790 373 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 VCPKMTQ9H867 229 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SENP1Q9P0U3 644 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP16Q9Y5T5 823 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 BTBD17A6NE02 478 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPM2AB3EWF7 344 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGEF9O43307 516 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTAG2O75638 210 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERPINB2P05120 415 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 FGF4P08620 206 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 UMPSP11172 480 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 GZMAP12544 262 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERPINA2P20848 420 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACVR1BP36896 505 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP1B3P54709 279 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 VLDLRP98155 873 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PUDPQ08623 228 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST3GAL3Q11203 375 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 MICAQ29983 383 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 C2CD6Q53TS8 623 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 AGR3Q8TD06 166 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST8SIA1Q92185 356 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBE2E3Q969T4 207 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF670Q9BS34 389 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 YY1AP1Q9H869 796 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUDT15Q9NV35 164 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PISDQ9UG56 409 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTC41PQ6P2S7 1318 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRR23AA6NEV1 266 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACOD1A6NK06 481 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC17A2O00624 439 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAMP3O60896 148 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 AP2A1O95782 977 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRT14P02533 472 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD55P08174 381 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 CT45A10P0DMU9 189 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANXA8P13928 327 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms