RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 ALG1L2C9J202 215 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CHP2O43745 196 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 REM1O75628 298 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 UTS2O95399 124 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GNAO1P09471 354 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ICAM2P13598 275 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 MMP11P24347 488 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CD82P27701 267 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GGT2P36268 569 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 FOLR3P41439 243 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 STAT5AP42229 794 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GSSP48637 474 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CRISP1P54107 249 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GABARAPL2P60520 117 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TSPAN31Q12999 210 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 SSPNQ14714 243 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 LAPTM4AQ15012 233 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 SEC23BQ15437 767 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ULK3Q6PHR2 472 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ZAR1Q86SH2 424 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ESX1Q8N693 406 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 OR4C3Q8NH37 302 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TTC9Q92623 222 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GPR87Q9BY21 358 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 LAT2Q9GZY6 243 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 SELENONQ9NZV5 590 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 RHCGQ9UBD6 479 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 DKK4Q9UBT3 224 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 SPTBP11277 2137 aa9.01□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0B4J2E0 115 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GX12 115 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN24A6NM45 220 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ZAR1LA6NP61 321 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 C21orf140B9A014 251 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF264O43296 627 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 PPM1BO75688 479 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CLPTM1O96005 669 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 UBL4AP11441 157 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 FPR3P25089 353 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ABCD3P28288 659 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 HLCSP50747 726 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CTBP2P56545 445 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CDC42P60953 191 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 COPZ1P61923 177 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 IL1RL1Q01638 556 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CDK5R2Q13319 367 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 APOFQ13790 326 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf141Q5SZD1 244 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 PLAG1Q6DJT9 500 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 LCN10Q6JVE6 187 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL17Q6TDP4 642 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ZER1Q7Z7L7 766 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CDK20Q8IZL9 346 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ARMC10Q8N2F6 343 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF786Q8N393 782 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GALNT6Q8NCL4 622 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TSPAN14Q8NG11 270 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 ELP5Q8TE02 316 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TMCO6Q96DC7 493 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 OMA1Q96E52 524 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 IMMP1LQ96LU5 166 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 TEX12Q9BXU0 123 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 PRRG3Q9BZD7 231 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 FAM192AQ9GZU8 254 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 MMP25Q9NPA2 562 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-202ENST00000409024 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms