RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CMTM4Q8IZR5 234 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 DMBX1Q8NFW5 382 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GANCQ8TET4 914 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 KLK11Q9UBX7 282 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.24■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 STC2O76061 302 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 PCDH8O95206 1070 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 SERPINA3P01011 423 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TSC22D1Q15714 1073 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CSRP2Q16527 193 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GLYATL2Q8WU03 294 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 SMPDL3AQ92484 453 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TMEM202A6NGA9 273 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 MT-ND5P03915 603 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 RPA2P15927 270 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ITGB8P26012 769 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 NANPQ8TBE9 248 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 PBX4Q9BYU1 374 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 KCNK12Q9HB15 430 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 DAPL1A0PJW8 107 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 AHRP35869 848 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 KCNJ3P48549 501 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ELP2Q6IA86 826 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 WDR34Q96EX3 536 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 PADI3Q9ULW8 664 aa20.23■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 DISC1C4P0D8 188 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 STX11O75558 287 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 NDUFB6O95139 128 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CNR1P21554 472 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ACVR1BP36896 505 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 STAT5AP42229 794 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TNFRSF17Q02223 184 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 HSPB3Q12988 150 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 IRF5Q13568 498 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CCDC157Q569K6 752 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 UBE2NLQ5JXB2 153 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZNF613Q6PF04 617 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 OR5D16Q8NGK9 328 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 LGALS14Q8TCE9 139 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ALG14Q96F25 216 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CMTM3Q96MX0 182 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 NDC1Q9BTX1 674 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 MFFQ9GZY8 342 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 KLF15Q9UIH9 416 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CEP350Q5VT06 3117 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 SPP1P10451 314 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 NR2F1P10589 423 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ZNF35P13682 527 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 FPR3P25089 353 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 CD52P31358 61 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GMFBP60983 142 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 FAM74A1Q5RGS3 127 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 FAAP20Q6NZ36 180 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TMIEQ8NEW7 156 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 WBP2Q969T9 261 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GINS4Q9BRT9 223 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.22■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 VNN2O95498 520 aa20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GP1BAP07359 652 aa20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 ALPPL2P10696 532 aa20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 NPPBP16860 134 aa20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 TAS2R41P59536 307 aa20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 GRB14Q14449 540 aa20.21■□□□□ 0.83
OPN3-201ENST00000366554 KRT33BQ14525 404 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms