RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 FAM26EQ8N5C1 309 aa23.64■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.376e-6■■■■□ 22.5
CLK2-201ENST00000355560 MED31Q9Y3C7 131 aa23.64■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 CDH10Q9Y6N8 788 aa23.64■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 PRR22Q8IZ63 422 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 LRR1Q96L50 414 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa23.63■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 A0A1W2PPW3 197 aa23.63■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 CDC14CA4D256 554 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 DCAF7P61962 342 aa23.63■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 EFNB1P98172 346 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 SYT14P1Q58G82 188 aa23.63■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 IL20RAQ9UHF4 553 aa23.63■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 ENPP5Q9UJA9 477 aa23.63■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 IDSB3KWA1 339 aa23.62■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 CTRCQ99895 268 aa23.62■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 TAS2R16Q9NYV7 291 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 HEATR5AQ86XA9 2040 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 UNC119BA6NIH7 251 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 EFCAB7A8K855 629 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 UTS2O95399 124 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 FUT1P19526 365 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 NR4A1P22736 598 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 ZNF91Q05481 1191 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 SLC25A30Q5SVS4 291 aa23.62■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 SLC29A4Q7RTT9 530 aa23.62■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 GPR52Q9Y2T5 361 aa23.62■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 MLLT10P55197 1068 aa23.6■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 FAM71CQ8NEG0 241 aa23.6■■□□□ 1.37
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CLK2-201ENST00000355560 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa23.6■■□□□ 1.37
CLK2-201ENST00000355560 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
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