RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339950.4

USP1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP1, Length 3,996 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1-201ENST00000339950 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ELP4Q96EB1 424 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 OR2M4Q96R27 311 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 OR2A14Q96R47 310 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 UNC119BA6NIH7 251 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CDC42EP2O14613 210 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 SOD1P00441 154 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 PSPHP78330 225 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 E2F1Q01094 437 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 KCNAB1Q14722 419 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 PARM1Q6UWI2 310 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ZNF511Q8NB15 262 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ORAI3Q9BRQ5 295 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 FUZQ9BT04 418 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ACSL5Q9ULC5 683 aa11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 LINC01553A4QN01 128 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 E9PI62 339 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TNFRSF10AO00220 468 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CHST10O43529 356 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CXCL10P02778 98 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 HRGP04196 525 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 OPRD1P41143 372 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 METRNLQ641Q3 311 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TMEM163Q8TC26 289 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 APOOQ9BUR5 198 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CCDC32Q9BV29 185 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 IL23AQ9NPF7 189 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 NAT1P18440 290 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CRYBB2P43320 205 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 STARP49675 285 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ADAM15Q13444 863 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 SAXO2Q658L1 398 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 KIF18BQ86Y91 864 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 OR1E3Q8WZA6 343 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 UBQLN3Q9H347 655 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 IDSB3KWA1 339 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 HK1P19367 917 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 FOXL2P58012 376 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 BTN1A1Q13410 526 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 PGGHGQ32M88 737 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 PLPP6Q8IY26 295 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TMEM239Q8WW34 195 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 RFT1Q96AA3 541 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ACTRT3Q9BYD9 372 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.12□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 TRIM64BA6NI03 449 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 DUXAA6NLW8 204 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 IMPA2O14732 288 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 STX11O75558 287 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 HMGN1P05114 100 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 UCHL1P09936 223 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ELK1P19419 428 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 FCN2Q15485 313 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 MAPK14Q16539 360 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 UBQLNLQ8IYU4 475 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 RDH10Q8IZV5 341 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 KDM8Q8N371 416 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 OR5W2Q8NH69 310 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 KCNN2Q9H2S1 579 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.11□□□□□ -0.63
USP1-201ENST00000339950 HYKKA2RU49 373 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms