RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 NNATQ16517 81 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 MEP1AQ16819 746 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL26Q53HC5 615 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 HSDL2Q6YN16 418 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ZAR1Q86SH2 424 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 P3H2Q8IVL5 708 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4C3Q8NH37 302 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8K3Q8NH51 312 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 TAAR9Q96RI9 348 aa9.31□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 TEX12Q9BXU0 123 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.31□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.31□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 NCDNQ9UBB6 729 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 PADI1Q9ULC6 663 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BN98 237 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.928e-15■■■■□ 24
RABGGTB-201ENST00000319942 UTS2O95399 124 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGPTL1O95841 491 aa9.3□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 TBXA2RP21731 343 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHA2P29317 976 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 STAT5AP42229 794 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 HLCSP50747 726 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC34A3Q8N130 599 aa9.3□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 MPP4Q96JB8 637 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ADOQ96SZ5 270 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.3□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.29□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 E9PQ18 207 aa9.29□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 LINGO3P0C6S8 592 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF28P17035 718 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 FUT4P22083 530 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP11P24347 488 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP24386 653 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CRHBPP24387 322 aa9.29□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 GIPRP48546 466 aa9.29□□□□□ -0.92
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 BROXQ5VW32 411 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 LCN10Q6JVE6 187 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CASP12Q6UXS9 341 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 NUBPLQ8TB37 319 aa9.29□□□□□ -0.92
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