RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 TIMP2P16035 220 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 EPCAMP16422 314 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 KCNJ5P48544 419 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HTR4Q13639 388 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CD163Q86VB7 1156 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GSX2Q9BZM3 304 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FN3KQ9H479 309 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LIPT1Q9Y234 373 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RENP00797 406 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CD22P20273 847 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 AKT2P31751 481 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PRKXP51817 358 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SSX6Q7RTT6 188 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 C1orf226A1L170 272 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 K7ESM1 405 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NAT1P18440 290 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NPR2P20594 1047 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LEG1Q6P5S2 330 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ABHD4Q8TB40 342 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 C3orf49Q96BT1 292 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR7D2Q96RA2 312 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 USP54Q70EL1 1684 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PSMA3P25788 255 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CD6P30203 668 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LSSP48449 732 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NRROSQ86YC3 692 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FAM46BQ96A09 425 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR2M2Q96R28 347 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CST11Q9H112 138 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 STARD5Q9NSY2 213 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CLDN4O14493 209 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NFATC1O95644 943 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MC2RQ01718 297 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 VASNQ6EMK4 673 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TMEM99Q8N816 258 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TEX19Q8NA77 164 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 CDHR4A6H8M9 788 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PLPP1O14494 284 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PEX14O75381 377 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 EVX1P49640 407 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 STOML3Q8TAV4 291 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NRTNQ99748 197 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SVILO95425 2214 aa14.69□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TGM5O43548 720 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FCMRO60667 390 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 FGF18O76093 207 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 NTN1O95631 604 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TEAD1P28347 426 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 WNT3P56703 355 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SHC2P98077 582 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TSPAN31Q12999 210 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 TMEM17Q86X19 198 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 SYT4Q9H2B2 425 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RHOP08100 348 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 PKLRP30613 574 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 MMP12P39900 470 aa14.68□□□□□ -0.06
USP43-201ENST00000285199 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms