RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF559Q9BR84 538 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRY4Q9C004 299 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 C17orf51A8MQB3 221 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 REM1O75628 298 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CYC1P08574 325 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 POU1F1P28069 291 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 COX10Q12887 443 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF613Q6PF04 617 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CBLN3Q6UW01 205 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HSDL2Q6YN16 418 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF566Q969W8 418 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OMA1Q96E52 524 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 STRADBQ9C0K7 418 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PISDQ9UG56 409 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GWA3 101 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf172C9J069 976 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ANGPTL1O95841 491 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNA8P32881 189 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP107P57740 925 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC26A5P58743 744 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB15P59190 212 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBA4AP68366 448 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC34A3Q8N130 599 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TP53INP1Q96A56 240 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 DSN1Q9H410 356 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC42EP2O14613 210 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM10O14672 748 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-CO3P00414 261 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGFQ07326 219 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN31Q12999 210 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SKP2Q13309 424 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PCOLCEQ15113 449 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NADK2Q4G0N4 442 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PFN4Q8NHR9 129 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 GRHL3Q8TE85 626 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 VMP1Q96GC9 406 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WXM4 84 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NGFRP08138 427 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC159P0C7I6 412 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT20P35900 424 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR4P46093 362 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CBX3Q13185 183 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF550Q7Z398 422 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF527Q8NB42 609 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NUBPLQ8TB37 319 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TAAR9Q96RI9 348 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BN98 237 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SCDO00767 359 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CHP2O43745 196 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 DLGAP3O95886 979 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IL12BP29460 328 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH3B2P48448 385 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PNLIPRP2P54317 469 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NR1H2P55055 460 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CXCR4P61073 352 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms