RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM164Q5U3C3 297 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 FNDC9Q8TBE3 224 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ACTL8Q9H568 366 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CD84Q9UIB8 345 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SARDHQ9UL12 918 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 I6L893 689 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 RNF13O43567 381 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CD1DP15813 335 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF84P51523 738 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PPA1Q15181 289 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GLB1L2Q8IW92 636 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 BBS10Q8TAM1 723 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PQY0 241 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GABRPO00591 440 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS3O15072 1205 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LILRB5O75023 590 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ACTR1BP42025 376 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MAP2K6P52564 334 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PDX1P52945 283 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ACTR1AP61163 376 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ARSIQ5FYB1 569 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 DPY19L4Q7Z388 723 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TEX26Q8N6G2 289 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GLYATL2Q8WU03 294 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 THAP4Q8WY91 577 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ALG8Q9BVK2 526 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PRO1933Q9H354 126 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MYH10P35580 1976 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 UQCRC2P22695 453 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 RBP2P50120 134 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SLC26A5P58743 744 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NKPD1Q17RQ9 610 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 AWAT2Q6E213 333 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 BAGE3Q86Y29 109 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 BAGE2Q86Y30 109 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PQLC3Q8N755 202 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 OR5H2Q8NGV7 314 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 DHDHQ9UQ10 334 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LINC00862A6NCI5 91 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 UNC119BA6NIH7 251 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ARNTLO00327 626 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 FGF4P08620 206 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NDUFV2P19404 249 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 IMPA1P29218 277 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 OSTM1Q86WC4 334 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TGM7Q96PF1 710 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM43Q9BTV4 400 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 C20orf24Q9BUV8 137 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PARPBPQ9NWS1 579 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GAB2Q9UQC2 676 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM82A0PJX8 343 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 HCKP08631 526 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ITGA5P08648 1049 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CAV2P51636 162 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CLDN8P56748 225 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CD81P60033 236 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CCL14Q16627 93 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 IQCJQ1A5X6 159 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LIPJQ5W064 366 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 B3GLCTQ6Y288 498 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 NRSN1Q8IZ57 195 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR13C4Q8NGS5 318 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SCMH1Q96GD3 660 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TECTBQ96PL2 329 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PTDSS2Q9BVG9 487 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 KCMF1Q9P0J7 381 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GTW7 788 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CSF2RBP32927 897 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 REEP5Q00765 189 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 MBTPS1Q14703 1052 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 MINDY4Q4G0A6 757 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 ZMAT1Q5H9K5 638 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 OR2T2Q6IF00 324 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 KDELC1Q6UW63 502 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 DPPA4Q7L190 304 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 IGSF21Q96ID5 467 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 RAD1O60671 282 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 VEZF1Q14119 521 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R3BQ86XI6 285 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms