RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 PRIM2P49643 509 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 NAA20P61599 178 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXF1Q12946 379 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP5Q16690 384 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SZRD1Q7Z422 152 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 HSD17B8Q92506 261 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 NEUROG1Q92886 237 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PPCDCQ96CD2 204 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 REEP4Q9H6H4 257 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 GP6Q9HCN6 339 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 NGBQ9NPG2 151 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TIGARQ9NQ88 270 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf109Q9NX04 203 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 DCDC2Q9UHG0 476 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 EMCNQ9ULC0 261 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 LIPT1Q9Y234 373 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 CADP27708 2225 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PP18 115 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 RIPK2O43353 540 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 AKAP10O43572 662 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 EFNA2O43921 213 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAP00813 363 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-39P01824 125 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ALOX5P09917 674 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 UROSP10746 265 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SDC1P18827 310 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINB4P48594 390 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF117Q03924 483 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 BSPH1Q075Z2 132 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGADQ13349 1161 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE7AQ13946 482 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 P2RY6Q15077 328 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PGGHGQ32M88 737 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNJQ5T5M9 372 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 FCRLAQ7L513 359 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TDRPQ86YL5 185 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 COX18Q8N8Q8 333 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 BANPQ8N9N5 519 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 MZB1Q8WU39 189 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 FCRL1Q96LA6 429 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TSSK3Q96PN8 268 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 CCT7Q99832 543 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM2Q9C040 744 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 DPRXA6NFQ7 191 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GJE1A6NN92 205 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF212BA8MTL3 300 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC28A1O00337 649 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF195O14628 629 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM11O75078 769 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFS7O75251 213 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GLRA3O75311 464 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKD3O94806 890 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPA4LO95757 839 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNA2P01563 188 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 PROCP04070 461 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 YES1P07947 543 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJB13P59910 316 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 FAPQ12884 760 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms