RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 LIPT1Q9Y234 373 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF6Q9Y252 685 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0G2JNJ9 132 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2M5A3KFT3 312 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 GMNCA6NCL1 334 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM247A6NEH6 219 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 CLDN24A6NM45 220 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 EVPLLA8MZ36 301 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 H0YC42 278 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BML4 177 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 FBP2O00757 339 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE2BO14633 110 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF264O43296 627 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFRSF21O75509 655 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 EPPINO95925 133 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 CSTAP01040 98 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 BCHEP06276 602 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRM4P08173 479 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TFPTP0C1Z6 253 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 UBL4AP11441 157 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 CPN1P15169 458 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 IL7RP16871 459 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 LHX2P50458 406 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 CCR4P51679 360 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 GNGT1P63211 74 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNJ10P78508 379 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 HPCAP84074 193 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 NFYCQ13952 458 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.425e-6■■□□□ 11.6
EFTUD2-211ENST00000588374 CDSNQ15517 529 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK11Q15759 364 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 MMEL1Q495T6 779 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 RETREG3Q86VR2 466 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR119Q8TDV5 335 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf82Q8WW14 230 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SMPDL3BQ92485 455 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 MAL2Q969L2 176 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 PIGQQ9BRB3 760 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 UCK2Q9BZX2 261 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 LAT2Q9GZY6 243 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 RUBCNLQ9H714 662 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SAR1AQ9NR31 198 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 POLE3Q9NRF9 147 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 MED17Q9NVC6 651 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 Q9UFV3 132 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-211ENST00000588374 SPTA1P02549 2419 aa6.15□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 MED12Q93074 2177 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 NBASA2RRP1 2371 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WZY1 265 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0G2JPF8 293 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 C5orf58C9J3I9 102 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS44E7EML9 344 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 H0Y3Z8 333 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC14L5O43304 696 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 EFNA2O43921 213 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0513O60268 411 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 TOXO94900 526 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 CLDN14O95500 239 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms