RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 JKAMPQ9P055 326 aa16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 MKLN1Q9UL63 735 aa16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 DTNAQ9Y4J8 743 aa16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CELSR2Q9HCU4 2923 aa16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOTCH2Q04721 2471 aa16■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CACNA1CQ13936 2221 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUXAA6NLW8 204 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNFSF11O14788 317 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FCMRO60667 390 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SOX30O94993 753 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAPN3P20807 821 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC6A8P48029 635 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCR4P51679 360 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR2A2Q6IF42 318 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAVSQ7Z434 540 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF18BQ86Y91 864 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR10D3Q8NH80 312 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB18Q99592 522 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIGMQ9H3S5 423 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 EXD2Q9NVH0 621 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CXCL13O43927 109 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 STX11O75558 287 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 AQP8O94778 261 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 GSNP06396 782 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 LINGO3P0C6S8 592 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SFTPDP35247 375 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PEX19P40855 299 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDKN2CP42773 168 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 P2RX1P51575 399 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 HCFC1P51610 2035 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 DPY19L1Q2PZI1 675 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATAD3BQ5T9A4 648 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SAXO2Q658L1 398 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 BTLAQ7Z6A9 289 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 STARD4Q96DR4 205 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR52E6Q96RD3 313 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PANX1Q96RD7 426 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 STOML1Q9UBI4 398 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FREM3P0C091 2139 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBN2P35556 2912 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 A8MXE2 369 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 DIAPH2O60879 1101 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CTAG2O75638 210 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 AK1P00568 194 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PGRP06401 933 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBL4AP11441 157 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ME2P23368 584 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SHC1P29353 583 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 KHKP50053 298 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAC1P63000 192 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTMPQ5BVD1 217 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF130Q86XS8 419 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXO27Q8NI29 283 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM222BQ8WU58 562 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF524Q96C55 264 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEURL3Q96EH8 262 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC115Q96NT0 180 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR52B2Q96RD2 323 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF122Q9H9V4 155 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 BTNL2Q9UIR0 455 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ICAM5Q9UMF0 924 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF175Q9Y473 711 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 MED12Q93074 2177 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A0J9YW62 118 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 C7orf72A4D263 438 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 SERINC4A6NH21 518 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.7 ms