RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	RCAN2	Q14206	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF141	Q15928	474 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MAPK14	Q16539	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SYPL1	Q16563	259 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MISP	Q8IVT2	679 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKFN1	Q8N957	763 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	POC1B	Q8TC44	478 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ZG16B	Q96DA0	208 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ITCH	Q96J02	903 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	EXD2	Q9NVH0	621 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR45	Q9Y484	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	SEC14L5	O43304	696 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA0513	O60268	411 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	H6PD	O95479	791 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	TGM6	O95932	706 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	AGR2	O95994	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	IL2RA	P01589	272 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	OPN1LW	P04000	364 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	CHRM4	P08173	479 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	PEPD	P12955	493 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPN3	P20807	821 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	IL11	P20809	199 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	CHRNE	Q04844	493 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXF2	Q12947	444 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	MAPK11	Q15759	364 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	HSPB2	Q16082	182 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ACBD4	Q8NC06	268 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	RUBCNL	Q9H714	662 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	RMND5A	Q9H871	391 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	FBN2	P35556	2912 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A087WZY1	265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	C7orf72	A4D263	438 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	CLDN24	A6NM45	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985		H3BNH8	94 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF264	O43296	627 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	EFNA2	O43921	213 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ANP32D	O95626	131 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT75	O95678	551 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	NUDT14	O95848	222 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	UBL4A	P11441	157 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ETFA	P13804	333 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	COX6B1	P14854	86 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF17	P17021	662 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	IGFBP2	P18065	325 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	BMP5	P22003	454 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP4B	P51164	291 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	P2RX1	P51575	399 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	DLX5	P56178	289 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	GUCY1A3	Q02108	690 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	PLAUR	Q03405	335 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXF1	Q12946	379 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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