RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL2	O95198	593 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF23	P17027	643 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	GGT1	P19440	569 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	HTR6	P50406	440 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	PDLIM4	P50479	330 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNE	Q04844	493 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	BRF2	Q9HAW0	419 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	GP6	Q9HCN6	339 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557		Q9N2J8	555 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.65	□□□□□ -0.7
BBS1-222	ENST00000533557		A0A096LPK6	155 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PNR3	127 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MANBA	O00462	879 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF195	O14628	629 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PCDH7	O60245	1069 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	COQ9	O75208	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	RAD51D	O75771	328 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CSF3	P09919	207 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SBK3	P0C264	359 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PTAFR	P25105	342 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MPI	P34949	423 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CBLN3	Q6UW01	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO27	Q8NI29	283 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	BBS4	Q96RK4	519 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ACPT	Q9BZG2	426 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.64	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557		M0R1B8	84 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	RGS14	O43566	566 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	LILRA1	O75019	489 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ME2	P23368	584 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SLC29A2	Q14542	456 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CARTPT	Q16568	116 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	C3orf56	Q8N813	242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	EQTN	Q9NQ60	294 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFS8	O00217	210 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	STX16	O14662	325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NKX2-2	O95096	273 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	H6PD	O95479	791 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NGFR	P08138	427 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ACP2	P11117	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	DDC	P20711	480 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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