RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FMODQ06828 376 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYCNQ0VAF6 134 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM52BQ4KMG9 183 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C9orf152Q5JTZ5 239 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MARCH8Q5T0T0 291 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTRB2Q6GPI1 263 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNCKQ6P2M8 343 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PODNL1Q6PEZ8 512 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SERPINA9Q86WD7 417 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VRK2Q86Y07 508 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RIMKLAQ8IXN7 391 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF679Q8IYX0 411 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 THEM5Q8N1Q8 247 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PYROXD2Q8N2H3 581 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GATSQ8NAP1 163 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR9A4Q8NGU2 314 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RDH11Q8TC12 318 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF139Q8WU17 664 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATP6V0A1Q93050 837 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM46BQ96A09 425 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF560Q96MR9 790 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TSG101Q99816 390 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATG101Q9BSB4 218 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TIMM29Q9BSF4 260 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR11A1Q9GZK7 315 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC25A22Q9H936 323 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RIMS3Q9UJD0 308 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EXOC7Q9UPT5 735 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NAV2Q8IVL1 2488 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1B0GVX0 72 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1W2PP18 115 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SGK1O00141 431 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHST1O43916 411 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NME6O75414 186 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALPPP05187 535 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHRNGP07510 517 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 THRBP10828 461 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNFSF10P50591 281 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF83P51522 516 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBX1P62877 108 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPL8P62917 257 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TGFBR3Q03167 851 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 REG3AQ06141 175 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF273Q14593 569 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TEX44Q53QW1 395 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERMARDQ5T6L9 678 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RTL6Q6ICC9 239 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASRGL1Q7L266 308 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WDR86Q86TI4 376 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LGI3Q8N145 548 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASB9Q96DX5 294 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACCSQ96QU6 501 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FERMT1Q9BQL6 677 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SDF4Q9BRK5 362 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FUNDC2Q9BWH2 189 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DCDC2Q9UHG0 476 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERVK-19Q9WJR5 959 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USP16Q9Y5T5 823 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ICE1Q9Y2F5 2266 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A087X0K7 114 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A0G2JN53 185 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SDHAF1A6NFY7 115 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C5orf52A6NGY3 159 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 H0YL77 283 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ST8SIA3O43173 380 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LALBAP00709 142 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL4P05112 153 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CT45A8P0DMV1 189 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CT45A9P0DMV2 189 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CGB7P0DN87 165 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ICAM2P13598 275 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF250P15622 560 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAPZA2P47755 286 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPY4RP50391 375 aa-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms