RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF691	Q5VV52	312 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TRABD2A	Q86V40	505 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FCGR1B	Q92637	280 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC38A4	Q969I6	547 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM203	Q969S6	136 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TESC	Q96BS2	214 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM10	Q96HG1	83 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PAFAH2	Q99487	392 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RBBP8	Q99708	897 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	LGR4	Q9BXB1	951 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	UCK2	Q9BZX2	261 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR76	Q9H967	626 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	BCO1	Q9HAY6	547 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR27	Q9NS67	375 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFP57	Q9NU63	452 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	VNN3	Q9NY84	501 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TREM2	Q9NZC2	230 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	AHSP	Q9NZD4	102 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ADA2	Q9NZK5	511 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	MSRA	Q9UJ68	235 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SCML1	Q9UN30	329 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		6.3	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0D9SEW6	157 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC160	A6NGH7	325 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	MROH6	A6NGR9	719 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	BHLHE40	O14503	412 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GOSR2	O14653	212 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PHYH	O14832	338 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OGG1	O15527	345 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	EMC8	O43402	210 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX1	O43812	170 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FADS1	O60427	444 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	UGT1A9	O60656	530 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PLIN3	O60664	434 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TBL1X	O60907	577 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CS	O75390	466 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RFPL2	O75678	378 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FTH1	P02794	183 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CYBB	P04839	570 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PROS1	P07225	676 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	IRF1	P10914	325 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRB1	P18505	474 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ACHE	P22303	614 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NME2	P22392	152 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRR1	P24046	479 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	MGAT1	P26572	445 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ACVRL1	P37023	503 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CCR8	P51685	355 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SGSH	P51688	502 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ADPRH	P54922	357 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	WNT3A	P56704	352 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RAP1B	P61224	184 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	EFNB1	P98172	346 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PDE7A	Q13946	482 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF235	Q14590	738 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TEAD2	Q15562	447 aa		6.29	□□□□□ -1.4

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