RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 COX18Q8N8Q8 333 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 RSC1A1Q92681 617 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PIGUQ9H490 435 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MED20Q9H944 212 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 IL20Q9NYY1 176 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SHISA7A6NL88 538 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 AKR7A2O43488 359 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 RDH16O75452 317 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 OR5F1O95221 314 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 GPR75O95800 540 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MSL3P1P0C860 447 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 GABRA3P34903 492 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 STAT5AP42229 794 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CAV3P56539 151 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 RAB40BQ12829 278 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ZNF620Q6ZNG0 422 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CA13Q8N1Q1 262 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ALX3O95076 343 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MAKP20794 623 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SDHBP21912 280 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 YPEL5P62699 121 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 DUSP8Q13202 625 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 INSL4Q14641 139 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PGGHGQ32M88 737 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ZNF544Q6NX49 715 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CPOQ8IVL8 374 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 OSTF1Q92882 214 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 NACC2Q96BF6 587 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TMCO6Q96DC7 493 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 IL21RQ9HBE5 538 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 V9GYH0 126 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MEIOCA2RUB1 952 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ST6GAL1P15907 406 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SDC2P34741 201 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 P2RX3P56373 397 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 FXYD6P3P58550 94 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PLAURQ03405 335 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 OR1Q1Q15612 314 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SMARCD3Q6STE5 483 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 MAP6Q96JE9 813 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 UBQLN3Q9H347 655 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD19PQ9H560 264 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 LYRM4Q9HD34 91 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 AGR2O95994 175 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 FABP5Q01469 135 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ZNF79Q15937 498 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 EOGTQ5NDL2 527 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 GJD3Q8N144 294 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 RLN3Q8WXF3 142 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 A0A0B4J293 547 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YY10 115 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PQ09 198 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 HRKO00198 91 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TSC22D2O75157 780 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 STX11O75558 287 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 LYPD3O95274 346 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ATP1B1P05026 303 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms