RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	FXYD1	O00168	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC28A1	O00337	649 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	MRAS	O14807	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	XRCC3	O43542	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	KCNJ13	O60928	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	LDB3	O75112	727 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CRCP	O75575	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	STK16	O75716	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	KDM4B	O94953	1096 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SOD1	P00441	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	FTH1	P02794	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CAPN1	P07384	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ANXA5	P08758	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC00032	P0C843	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ADRA2C	P18825	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	EPOR	P19235	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HMOX2	P30519	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HNMT	P50135	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HTR6	P50406	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	AP1S2	P56377	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	MS4A2	Q01362	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HSPB3	Q12988	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	RUNX3	Q13761	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ENPP2	Q13822	863 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	RCAN2	Q14206	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF234	Q14588	700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC6	Q16204	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	EGFL8	Q99944	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PP18	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CFLAR	O15519	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CLDN9	O95484	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	GUCA1C	O95843	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	NPPA	P01160	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HLA-E	P13747	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	ADRB3	P13945	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	HSD17B1	P14061	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	MYOD1	P15172	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	CYP2A7	P20853	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZNF638-223	ENST00000492262	MPZ	P25189	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms